Změny v oblasti II. a III. pilíře

II : zahraniční a bezpečnostní politika – vztahují se na humanitární a záchranné akce, participace čl. států: přijímání aktů společných strategií, zásad a směrů Společenství v zahraniční a bezpečnostní politice,
III  spolupráce ve vnitřní a bezpečnostní politice, ruší se společné postupy v rámci III. pilíře a dnes se realizuje prostřednictvím rámcových rozhodnutí
společné postoje – vymezuje přístup Unie k určité otázce (jen doporučující charakter)
úmluvy – doporučují členským státům přijetí souladu s ústavou,
závazné akty :rozhodnutí a rámcová rozhodnutí – nemají přímý účinek, možný výklad ESD
Rámcová rozhodnutí se svou formou blíží směrnicím (závaznost, není bezprostřední účinek). Vztahují se pouze k otázkám sbližování práva.

Schengen : z Dublinské úmluvy úprava volného pohybu osob uvnitř hranic EU, přesunuto ze SEU do SES,  Rada do 5 let po platnosti Amsterodamské smlouvy přijme opatření k zajištění, aby občané EU nebyli kontrolováni po překročení vnitřních hranic, upraví vízovou povinnost,
Institucionální reforma EU : zvyšování počtu členů EP, poprvé stanoven strop (700 členů, Nicejská smlouva zvýšila)
– posílení úlohy při nominaci ostatních členů,
– zjednodušení spolurozhodovacího procesu, rozšíření případů, kdy R rozhoduje kvalifikovanou většinou – jednomyslnost výjimečně

princip flexibility
určitá skupina států v rámci EU provádí společnou politiku (užší spolupráci v rámci I, II i III pilíře), ostatní státy nejsou zainteresovány, ale uvedenému postupu nebrání, zůstávají stranou a nepřekáží v provádění avantgardních politik, ale také nejsou pak uvedenými činnostmi dotčeny.
princip flexibility = výjimka ze zásady jednomyslnosti, musí vždy znamenat pokrok, musí směřovat k dosažení cílů Unie a musí se týkat většiny členských států. Nesmí se dotknout acquis communautaire ani nezúčastněných států, ale musí jim být otevřena.
kde se neuplatní  pokud jde o výlučnou pravomoc ES, ne politiky kde akce společenství, ne občanům unie, ne diskriminace státem příslušníka členského státu, ne diskriminace obchodu čl. státu a hospodářských služeb